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Gene silencing

by Biomann 2021. 11. 12.
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Gene silencing is the regulation of gene expression in a cell to prevent the expression of a certain gene. Gene silencing can occur during either transcription or translation and is often used in research.
In particular, methods used to silence genes are being increasingly used to produce therapeutics to combat cancer and other diseases, such as infectious diseases and neurodegenerative disorders.

따라서 자신들이 사용하지 않는 유전자들은 이질염색질(Heterochromatin)이라 불리는 응축된 염색질 구조 안에 봉인시켜 버린다.

(응축된 염색질 구조에는 전사 인자를 포함한 DNA 결합 단백질들이 결합하기가 매우 어렵다는 것을 기억할 것이다)


Gene silencing is often considered the same as gene knockdown. When genes are silenced, their expression is reduced.
In contrast, when genes are knocked out, they are completely erased from the organism's genome and, thus, have no expression. Gene silencing is considered a gene knockdown mechanism since the methods used to silence genes, such as RNAi, CRISPR, or siRNA, generally reduce the expression of a gene by at least 70% but do not eliminate it. Methods using gene silencing are often considered better than gene knockouts since they allow researchers to study essential genes that are required for the animal models to survive and cannot be removed. In addition, they provide a more complete view on the development of diseases since diseases are generally associated with genes that have a reduced expression.

RNA interference (RNAi)
https://easymemory.tistory.com/m/10

RNA interference (RNAi)

RNA 간섭(영어: RNA interference;RNAi)은 세포 내에서 활성화 상태의 유전자와 그렇지 않은 유전자를 구별하는 역할을 한다. microRNA(miRNA)와 small interfering RNA(siRNA)와 같은 두 가지의 작은 RNA 분자(sm..

easymemory.tistory.com


하지만 이것 외에도 전사된 RNA를 siRNA의 RNA 간섭(RNA interference)을 통해 제거하거나 단백질 합성이 억제되기도 하며, 트랜스포존 침묵(Transposon silencing), 유전체 각인(Genomic Imprinting)등 많은 세부적인 기전이 존재한다.

그렇다면 먼저, 효모에서의 유전자 침묵화는 주로 히스톤의 탈아세틸화 및 메틸화에 의해 일어난다.

효모에서의 유전자 침묵부위는 크게 세 군데로,
말단소체(Telomere),
rDNA 반복서열,
다른 교배형 유전자 부위
가 있다.

말단소체에서의 이질염색체 형성에 대해서 살펴보자.

각 염색체의 마지막 1~5kb 부위(말단소체)는 강하게 응축하여 유전자의 발현이 크게 억제되는데, 실험적으로 이 부위에 다른 곳에 위치한 유전자를 옮겨놓으면 그 유전자의 발현도 함께 억제된다.
이 부분은 진정염색질(Euchromatin)부위에 비해 히스톤 단백질의 아세틸화 정도가 많이 약하다. 히스톤의 아세틸화는 염색질 구조를 느슨하게 한다는 것을 기억하자.

참고
https://m.blog.naver.com/PostView.naver?isHttpsRedirect=true&blogId=ling1134&logNo=70169702537#:~:text=%EC%9C%A0%EC%A0%84%EC%9E%90%20%EC%B9%A8%EB%AC%B5%ED%99%94%EB%8A%94%20%EB%8B%A4%EC%84%B8%ED%8F%AC,%EC%84%A0%20%EC%95%88%20%EB%90%9C%EB%8B%A4%EB%8A%94%20%EB%9C%BB%EC%9D%B4%EB%8B%A4.



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